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构建全省农作物种质资源保护体系
《方案》强调项目为王，在推动国家布局项目落实的基础上，拟再实施一批具有基础支撑的种兴振兴项目。
规划建设一批农作物种业提升工程，重点支持大宗农作物和特色优势农作物种业发展，建设现代农作物种业体系。对于农作物种质资源保护利用能力提升项目，《方案》明确依托科研单位、高校等建设种质资源库（区域性中心库）、种质资源圃、农业野生植物原生境保护区，构建全省农作物种质资源保护体系。
建设一批畜禽种业能力提升工程，以主要畜种为重点，围绕畜禽种质资源保护、育种创新、测试评价、良种繁育等建设现代畜禽种业体系。针对畜禽制（繁）种能力提升项目，《方案》重点以保障优良畜禽供应为目标，新建和改扩建种公畜站，提升畜禽生产能力和生产质量。
建设一批水产种业能力提升工程，以主要水产品种为重点，围绕水产种质资源保护、育种创新、测试评价、良种繁育等内容建设现代水产种业体系。《方案》中，水产种质资源保护利用能力提升项目，对河南主要水生生物种类和养殖品种进行收集、整理、鉴定、保存工作，为种质资源保护与品种改良提供遗传材料。
建设一批食用菌种业提升工程，支持大宗食用菌和特色优势菌类种业发展，围绕食用菌种质资源保、育、测、繁等内容建设与食用菌生产大省相适应的食用菌种业育繁推体系。对于食用菌种质资源保护利用能力提升项目，《方案》重点对香菇、平菇、木耳等大宗食用菌生产和野生种类资源进行普查、收集、鉴定、保存，为品种改良提供遗传资源。